独行月球结局是独孤月留在月球，牺牲了自己。
在电影中，独孤月是一个技艺高超的工程师，只是为了追求马蓝星而做了维修工，因此显得无所不为，但在漫画中，独孤月只是一个研究食用动物的普通研究员，那只袋鼠其实就是他的食物。
电影结局，独孤月抱着核弹向小行星π冲去，那个场面惊心动魄，虽然独孤月牺牲了，但在全世界的直播中，在自己心爱的人的眼中牺牲的，那时候的独孤月不寂寞。
可是在漫画中，独孤月也面临着小行星π的威胁，也把袋鼠送回了地球。他独自留在月球发射核弹摧毁了π，但π的碎片把几乎整个月球基地都毁了，独孤月没有牺牲，却只能生活在黑暗的地下室，过了17年，人类终于恢复了科技，卡萝尔带人来救独孤月，但独孤月早就在饥饿和无尽的黑暗中死去。
这样的结局其实比电影版更加悲惨，可以看出开心麻花为了观众的体验真的改动了很多，当然了这种改动是好是坏就留给观众评判了。
独行月球大结局独孤月牺牲了。
由于小行星要撞击地球了，人类启动了“月盾计划”，让月球为地球挡住小行星的冲击，为此招募相关技术人员上月球，本来是来应聘工程师的独孤月，工程师招满，就在准备离开的时候，在人群中看到了月盾计划的总指挥长马蓝星，便陷入了一场暗恋中，于是放弃了对岗位的要求，以一名低级维修工的身份加入了月盾计划。
月盾计划失败，全部人员撤离月球，但是独孤月因为沉浸在自己计划的表白中，错过了返回的时间，于是自己被留在了月球，然后他发现还有一只金刚袋鼠也被留了下来，经过一番相处之后，他唯一的朋友“刚子”，也成了他重返地球的唯一伙伴。
准备了近3年的，终于迎来返回地球的时机，当独孤月和“刚子”搭上回地球的火箭，马上要与心系了多年的爱人相见，激动、期待心情无比复杂，但是却听到了马蓝星和同事们的对话，还有一个陨石“π+”将撞击地球，而只有他可以解决这场危机，“宇宙之锤”可以击碎“π+”但却是牺牲自己为代价。
当独孤月做好牺牲准备，依然没有忘记爱护他的“刚子”，他将刚子送入逃生舱，他给刚子放上摇滚乐，让它在音乐声中飞回地球，隔着窗户刚子那不舍的眼神，知道这次是真的要和他分别了，独孤月不舍中带着坚定的眼神，笑着哭着祝福它：“你要长寿无疆，找一个母袋鼠生一窝小袋鼠。
这一刻就是一个原本平凡的普通人，做了一件非凡的英雄事，中国人的侠义精神展现无遗，却也有着悲壮的浪漫。
影片就这样迎来了结局，在浩瀚的银河里，一个人独自消失在这里，却带给人类走向明天，陨石碎片本应被月球吸收，可是π+形成了环绕地球的星环，这是独孤月对地球的渴望，因为他说过：“有人说，人死了会变成星星，我不想，因为那距离你太遥远了。“